Please use this identifier to cite or link to this item: http://hdl.handle.net/11452/3420
Full metadata record
DC FieldValueLanguage
dc.contributor.advisorAltun, Soner-
dc.contributor.authorDuman, Muhammed-
dc.date.accessioned2019-12-17T12:45:55Z-
dc.date.available2019-12-17T12:45:55Z-
dc.date.issued2017-08-24-
dc.identifier.citationDuman, M. (2017). Gökkuşağı alabalıklarında görülen Motil Aeromonas (Aeromonas hydrophila, A. sobria, A. caviae), Yersinia ruckeri ve Lactococcus garvieae bakterilerinin antimikrobiyal duyarlılıkları ve duyarlılıkta rol oynayan genlerin tespiti. Yayınlanmamış doktora tezi. Uludağ Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü.tr_TR
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11452/3420-
dc.description.abstractBu araştırmada, farklı kökenlere sahip Motil Aeromonas spp. (Aeromonas hydrophila, A. sobria, A. caviae), Yersinia ruckeri ve Lactococcus garvieae izolatlarının moleküler karakterizasyonu, antimikrobiyal duyarlılıkları ve antimikrobiyal direnç gelişiminde rol oynayan genlerin tespiti yapılmıştır. Çalışmada hareketli Aeromonas, Y. ruckeri ve L. garvieae izolatlarının biyokimyasal özelliklerinin belirlenmesinde klasik mikrobiyolojik testler (gram boyama, hareketlilik, oksidaz, katalaz, O/F vb.) ve hızlı teşhis kitleri (API 20NE, API 32 STREPT ve API 32E) kullanılmıştır. Hareketli Aeromonas türlerinin identifikasyonu gyrB bölgesinin dizi analizi ile Y. ruckeri ve L. garvieae izolatlarının identifikasyonu ise sırasıyla YER8-YER10, pLG primerleri kullanılarak PCR analizi ile gerçekleştirilmiştir. Y. ruckeri ve L. garvieae izolatlarının genotiplendirilmesi RAPD-PCR, hareketli Aeromonas izolatlarının genetik yakınlıkları ise gyrB bölgesinin dizi analizi ile (Bionumerics 7.0 yazılımı kullanılarak) yapılmıştır. Ayrıca çalışmada kullanılan tüm izolatların sulfanomid, tetrasiklin, florfenikol ile sulfamethoksazol-trimetoprim antimikrobiyallerinde minimum inhibitör konsantrasyonları (MİK) ve bu antimikrobiyallere karşı geliştirdikleri direnç genleri (PCR ve dizi analiziyle) tespit edilmiştir. Araştırmada 6 adedi ülkemizde ilk bildirim olmak üzere toplam 13 motil Aeromonas türü, 18 farklı Y. ruckeri ve 5 farklı L. garvieae genotipi belirlenmiştir. Hareketli Aeromonas türlerinin yaygın olarak sulfanomid ve florfenikole; Y. ruckeri izolatlarının sulfanomid ve tetrasiklin'e; L. garvieae izolatlarının ise sulfonamid ve florfenikol'e direnç geliştirmiş olduğu görülmüştür. Ayrıca Aeromonas türlerinde sulI, tetA, tetE, flor; Y. ruckeri izolatlarında sulI; L. garvieae izolatlarında ise ermA ve tetS genlerinin yaygın olduğu tespit edilmiştir.tr_TR
dc.description.abstract"Determination of Antimicrobial senstivity and antimicrobial resistance genes of Motile Aeromonads (Aeromonas hydrophila, A. sobria, A. caviae), Yersinia ruckeri and Lactococcus garvieae in rainbow trout" Determination of molecular characteristics, antimicrobial susceptibility and resistance genes in motile Aeromonas spp. (Aeromonas hydrophila, A. sobria, A. caviae), Yersinia ruckeri and Lactococcus garvieae isolates that isolated from different origin were performed in this study. The classical biochemical tests (gram stain, motility, oxidase, catalase, O/F etc.) and rapid test kits (API 20NE, API 32 STREPT ve API 32E) were used for determination of biochemical characteristics of motile Aeromonas spp., Yersinia ruckeri and Lactococcus garvieae isolates in our study. Identification of motile Aeromonas isolates were performed with sequence analayses of gyrB gene region, Y. ruckeri and L. garvieae isolates were identified with YER8-YER10, pLG primer pairs, respectively. Yersinia ruckeri and Lactococcus garvieae isolates were genotyped using RAPD-PCR method, and also motile Aeromonas isolates were genogrouped based on sequence of gyrB gene region (using Bionumerics 7.0 software). Beside, all isolates were investigated for susceptibility of sulfonamide, tetracycline, florfenicole and sulfamethoxazole-trimetoprime using minimum inhibitor concentration (MIC) test and antimicrobial resistance genes related to these compounds were detected using PCR and sequence analyses. There are 13 different motile Aeromonas species that were six of them firstly reported in our country, 18 Y. ruckeri and 5 different L. garvieae genotype were identified in this study. Motile Aeromonas species are commonly found in sulfanomide and florfenicole; Y. ruckeri isolates to sulfanomide and tetracycline; L. garvieae isolates were found resistance to sulphonamide and florfenicole. In addition, sulI, tetA, tetE, floR in Aeromonas species; sulI in Y. ruckeri isolates; ermA and tetS genes in L. garvieae isolates, were commonly detected resistance genes.en_US
dc.format.extentVII, 117 sayfatr_TR
dc.language.isotrtr_TR
dc.publisherUludağ Üniversitesitr_TR
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.rightsAtıf 4.0 Uluslararasıtr_TR
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by/4.0/*
dc.subjectHareketli aeromonas septisemitr_TR
dc.subjectYersinia ruckeritr_TR
dc.subjectLactococcus garvieaetr_TR
dc.subjectAntimikrobiyal dirençtr_TR
dc.subjectMotile aeromonas septicemiatr_TR
dc.subjectAntimicrobial resistanceen_US
dc.titleGökkuşağı alabalıklarında görülen Motil aeromonas (Aeromonas hydrophila, A. sobria, A. caviae), Yersinia ruckeri ve Lactococcus garvieae bakterilerinin antimikrobiyal duyarlılıkları ve duyarlılıkta rol oynayan genlerin tespititr_TR
dc.title.alternativeDetermination of antimicrobial senstivity and antimicrobial resistance genes of Motile aeromonads (Aeromonas hydrophila, A. sobria, A. caviae), Yersinia ruckeri and Lactococcus garvieae in rainbow trouten_US
dc.typedoctoralThesisen_US
dc.relation.publicationcategoryTeztr_TR
dc.contributor.departmentUludağ Üniversitesi/Sağlık Bilimleri Enstitüsü/Su Ürünleri Anabilim Dalı/Hastalıklar Bilim Dalı.tr_TR
dc.relation.bapÜSİP (V) 2013/1tr_TR
dc.relation.bapTAGEM 14 AR-GE/26tr_TR
dc.relation.bapKUAP(V) 2014-07tr_TR
Appears in Collections:Sağlık Bilimleri Doktora Tezleri / PhD Dissertations

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
487123.pdf5.92 MBAdobe PDFThumbnail
View/Open


This item is licensed under a Creative Commons License Creative Commons