Bu öğeden alıntı yapmak, öğeye bağlanmak için bu tanımlayıcıyı kullanınız: http://hdl.handle.net/11452/28141
Başlık: Boz ve yerli kara sığır ırklarında kalpain 1 p.ala316gly genotiplerine ait genetik varyasyonun belirlenmesi
Yazarlar: Bursa Uludağ Üniversitesi/Veteriner Fakültesi/Genetik Anabilim Dalı.
0000-0003-2758-5945
0000-0001-9633-634X
Ardıçlı, Sena
Çobanoğlu, Özden
Anahtar kelimeler: Boz ırk
Yerli kara
CAPN1
Tek nükleotit polimorfizmi
Popülasyon genetiği
Turkish grey steppe cattle
Anatolian black cattle
Single nucleotide polymorphism
Population genetics
Yayın Tarihi: 26-Tem-2022
Yayıncı: Bursa Uludağ Üniversitesi
Atıf: Ardıçlı, S. ve Çobanoğlu, Ö. (2022). "Boz ve yerli kara sığır ırklarında kalpain 1 p.ala316gly genotiplerine ait genetik varyasyonun belirlenmesi". Veteriner Hekimlikte Araştırma Dergisi, 41(1), 55-61.
Özet: Kalpain 1 (CAPN1) geni, mikromolar kalsiyum–aktive nötral proteaz geni olarak bilinir ve postmortem koşullarda miyofibriler proteinleri indirgeyen kalsiyum bağımlı sistein proteazı, μ-kalpaini ayrıştırır. Bu genin kas metabolizması ve gelişimi üzerinde önemli etkileri vardır. Bu gen, çeşitli sığır ırkları arasında geniş çapta çalışılmış olmasına rağmen, Türk yerli sığırları hakkında sınırlı bilgi bulunmaktadır. Bu nedenle bu çalışma, bazı Türk yerli sığır ırklarında CAPN1 p.Ala316Gly polimorfizmine ait genetik varyasyonu belirlemeyi amaçlamıştır. Bu kapsamda 99 Boz ve 41 Yerli Kara ırkı erkek sığır PCR-RFLP metodu kullanılarak genotiplendirilmiştir. Genotipik ve alelik frekanslar, Hardy-Weinberg dengesi (HWE), heterozigotluk (He), polimorfizm bilgi içeriği (PIC), efektif alel sayısı (Ne), fiksasyon indeksi (Fıs), olası varyasyon gerçekleşme düzeyi (%V) dahil olmak üzere popülasyon genetik parametreleri değerlendirilmiştir. Ayrıca Shannon-Weaver indeksi, Simpson dominantlık indeksi ve Gini katsayısını içeren biyoçeşitlilik indeksleri hesaplanmıştır. Sonuçlar, GG genotipinin her iki yerli ırkta da oldukça baskın olduğunu ortaya koydu. Öte yandan, toplam popülasyonda CC genotipinin bulunmadığı gözlenmiştir. Bu durum dikkate değer düzeyde düşük C alel frekansıyla sonuçlanmıştır (Boz ve Yerli Kara için sırasıyla 0.13 ve 0.12). Fisher’ın kesin testi, HWE’den sapma oldğunu, popülasyon genetiği parametreleri ise, incelenen ırklarda oldukça düşük bir genetik varyasyon düzeyi olduğunu göstermiştir. Bu gözlem, düşük seviyedeki biyolojik çeşitlilik seviyeleri ile desteklenmiştir. Nitekim CAPN1 markörü, Boz ve Yerli Kara sığırları için düşük seviyede bilgilendiricilik göstermiştir ancak Türkiye’deki yerli sığır ırklarının genetik karakteri hakkında ileride yapılacak çalışmalara ihtiyaç vardır. Yerli ırklarda yapılacak moleküler genetik çalışmalar, önemli biyolojik süreçlerle ilgili daha geniş perspektifleri ortaya koymak ve büyüme, kas gelişimi ve yemden yararlanma gibi kompleks özelliklerin daha iyi anlaşılmasını sağlamak için teşvik edilmelidir.
Açıklama: Bu çalışma, 1-3 Eylül 2021 tarihlerinde Edirne[Türkiye]'de düzenlenen III. International Agricultural, Biological, and Life Science Conference (AGBIOL 2021)'da bildiri olarak sunulmuştur.
URI: https://dergipark.org.tr/tr/download/article-file/2320511
https://doi.org/10.30782/jrvm.1090467
http://hdl.handle.net/11452/28141
ISSN: 1301-3173
Koleksiyonlarda Görünür:2022 Cilt 41 Sayı 1

Bu öğenin dosyaları:
Dosya Açıklama BoyutBiçim 
41_1_9.pdf308.39 kBAdobe PDFKüçük resim
Göster/Aç


Bu öğe kapsamında lisanslı Creative Commons License Creative Commons